SIMAP WUs im April
Simap wird Anfang April leider nur eine verhältnismässig kleine Serie neuer WUs haben.
Schätzungsweise ca.
50.000 SIMAP Workunits
und
10.000 HMMER Workunits.
Das ist nur wenig Arbeit. Aber die gute Nachricht ist: die Menge der monatlich neuen Proteine ist ziemlich gleichbleibend, so ca. 200.000.
Da nur wenige Proteine aus der Datenbank rausfallen, wird sie ja immer groesser (momentan 7 Mio Sequenzen).
Der Rechenaufwand waechst quadratisch, also wird es pro Monat immer ein wenig mehr Arbeit geben
– Miko –
April 3rd, 2007 at 20:39
Beim Start der Serie gab es ziemliche Probleme mit dem Dataserver der fuer den download verantwortlich ist. Durch die hohe Last blockierte er morgens, obwohl es vorher problemlos anlief. Es ist momentan noch unklar, was genau zu der I/O Blockade fuehrt.
Der Fehler ist inzwischen erkannt und beseitigt!
Wenn die aktuelle Berechnung fertig ist, wird der dataserver fuer den download separate Plattensysteme erhalten, so dass Simap kuenftig den hohen Durchsatz beim Beginn einer Berechnungsperiode besser bewaeltigen kann.
– Miko –
April 7th, 2007 at 20:20
Die WUs sind alle weggerechnet,
bis zum Anfang des nächsten Monats wird Simap ohne Arbeit sein.
– Miko –